菊芋果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析  

高洁铭1,2 , 杨世鹏1 , 王丽慧1 , 张亚琦1 , 王艳萍2* , 孙雪梅1*
1青海大学农林科学院,青海省蔬菜遗传与生理重点实验室,西宁, 810016; 2青海大学农牧学院,西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2019年05月05日    接受日期: 2019年05月10日    发表日期: 2021年01月20日
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摘要

果聚糖是菊芋的主要贮藏物质,其代谢与产量形成和逆境适应性密切相关。为了解菊芋果聚糖合成代谢的机制,本研究以‘青芋 1号’为研究对象,利用同源克隆方法,对果聚糖合成关键基因1-SST 克隆及序列分析。结果表明,1-SST 基因全长为 3 925 bp,CDS大小为 1 890 bp,由 5个内含子和 6个外显子组成。经生物信息学分析,预测 1-SST蛋白分子量 70 934.40 Da,等电点 5.10,有两个属于糖基水解酶 32家族的保守区,属于亲水性蛋白,以延伸结构(24.48%)和无规则卷曲(56.76%)为主要二级结构,在质膜外行使功能。系统进化分析表明,菊芋1-SST 基因与向日葵遗传距离最近,与龙舌兰等不同科不同属的植物进化距离较远。本研究基于对菊芋中调控果聚糖合成代谢1-SST 基因的克隆与生物信息学分析,为高等植物果聚糖代谢途径研究奠定一定的理论基础。

关键词
菊芋(Helianthus tuberosus L.);1-SST;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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